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La institución desarrolla acciones tendientes a asegurar la calidad y sanidad de los distintos productos y tecnologías vinculados a la medicina, la alimentación y la cosmética.
Si bien la ejecución física se halla fuertemente influida por la demanda, a partir del año 2002, el cambio socioeconómico, la declaración de la emergencia sanitaria y las políticas establecidas por el Ministerio de Salud incidieron en forma marcada en la producción de la ANMAT y expusieron públicamente sus responsabilidades.
La obligatoriedad de la prescripción de medicamentos por su principio activo (nombre genérico) incidió en las tareas desarrolladas por el Instituto Nacional de Medicamentos (INAME) que debió incrementar las inspecciones, análisis y las tareas de farmacovigilancia.
Asimismo, la ANMAT interviene en el control de las donaciones provenientes de distintos países, realizando inspecciones y análisis de medicamentos, alimentos y material biomédico.