El crédito vigente asignado al INIDEP se mantuvo en los mismos niveles que el asignado durante el año 2003. Con referencia al crédito devengado, la actividad de armamento de buques representó el 47,1% de las erogaciones realizadas, las actividades de pesquerías, información, operación, tecnología y control constituyeron el 34,8% y el 18,1% restante correspondió a la dirección y administración. En cuanto a la estructura del gasto, el gasto en personal representa el 51,6% de las erogaciones efectuadas, los bienes de consumo constituyen el 21,6% y los servicios no personales el 21%.

Las actividades permanentes que realiza la entidad están relacionadas con la obtención de información a partir de campañas en buques de investigación, observadores a bordo de la flota comercial y muestreo de desembarque. Se realiza el relevamiento ambiental a partir de muestreos de campo y telemetría satelital. De este modo, en función de los datos recopilados en las campañas, se genera la proyección del estado de los recursos en el futuro, teniendo en cuenta cambios de origen natural y/o antrópico.

Asimismo, es de su competencia la adaptación de instalaciones para la producción masiva de semillas de especies marinas, utilizando mecanismos de cooperación técnica internacional, así como también le compete extender la penetración de nuevos productos de las especies tradicionales e incorporar al circuito comercial especies no tradicionales.

Además, se efectúa el análisis económico de la viabilidad de las pesquerías bajo el nuevo sistema regulatorio, estimando las fluctuaciones del valor de los efectivos pesqueros bajo explotación.